自治州第十六届人民代表大会第一次会议以来，玛纳斯县选出的李刚、葛坦、王岩，呼图壁县选出的宋志武、卫新璞，昌吉市选出的秦伟、刘婉琳、肖鹏，阜康市选出的丁永平、洪峰，奇台县选出的宁新，因工作变动先后调离本行政区域。依照代表法的规定，李刚、葛坦、王岩、宋志武、卫新璞、秦伟、刘婉琳、肖鹏、丁永平、洪峰、宁新的代表资格自行终止。

　　由玛纳斯县选出的杨彦军，呼图壁县选出的易萍，昌吉市选出的张颖，吉木萨尔县选出的钮鸿林，昌吉军分区选出的许玉成，因职务变动等原因提出辞去代表职务被选举单位接受。依照代表法的规定，杨彦军、易萍、张颖、钮鸿林、许玉成的代表资格终止。

　　玛纳斯县第十八届人大常委会第十二次会议补选王路平、何东生为昌吉回族自治州第十六届人民代表大会代表。呼图壁县第十八届人大常委会第八次会议补选李忠为昌吉回族自治州第十六届人民代表大会代表。昌吉市第十届人大常委会第七次会议补选李长江、柳学珍、潘斌为昌吉回族自治州第十六届人民代表大会代表。阜康市第七届人大常委会第十二次会议补选刘鹓、索敏为昌吉回族自治州第十六届人民代表大会代表。吉木萨尔县第十八届人大常委会第九次会议补选克尤木·热依木为昌吉回族自治州第十六届人民代表大会代表。奇台县第十八届人大常委会第十四次会议补选方俊申为昌吉回族自治州第十六届人民代表大会代表。木垒县第十八届人大常委会第十次会议补选魏新为昌吉回族自治州第十六届人民代表大会代表。新疆昌吉军分区军人大会补选尹子民为昌吉回族自治州第十六届人民代表大会代表。

　　昌吉回族自治州第十六届人民代表大会常务委员会第六次会议同意自治州人民代表大会常务委员会代表资格审查委员会的审查报告，确认王路平、何东生、李忠、李长江、柳学珍、潘斌、刘鹓、索敏、克尤木·热依木、方俊申、魏新、尹子民的代表资格有效。

　　截至目前，昌吉回族自治州第十六届人民代表大会实有代表346人。